|
|
Electrochemical biosensor for the study of DNA methylation
Petrula, Jakub ; Hrdý, Radim (referee) ; Hynek, David (advisor)
This bachelor’s thesis deals with design and optimalisation of custom biosensor for detection of methylated DNA. Teoretical part explains the mechanism and importance of DNA methylation. Next section describes analytical methods used in connection with DNA methylation and some basic direct and indirect methods of detection. Final part is dedicated to experiment itself, which is divided into several sections. Section one deals witch modification of working electrode and optimalisation of detection method. Second section introduces two different ways of DNA methylation detection. First is based on direct detection and second one on detection through the biosensor. Final part shows determination of methylcytosine from sample based on analysing characteristic attributes of signal and numeric algorithm based on curve fitting.
|
|
|
Typing of bacterial populations based on methylation site detection
Hlavatá, Kristína ; Sedlář, Karel (referee) ; Škutková, Helena (advisor)
Táto bakalárska práca sa zameriava na detekciu metylácií DNA a vývoj metodiky typizácie bakteriálnych kmeňov. DNA metylácie hrajú kľúčovú úlohu ako regulačný mechanizmus v genóme, ktorý ovplyvňuje konečné vlastnosti organizmov. Použili sme DeepSignal2 na detekciu metylačných vzorov v 10 kmeňoch Klebsielly pneumoniae. Okrem toho sme navrhli metódu typizácie na základe identifikovaných metylácií pre kategorizáciu bakteriálnych kmeňov. Táto práca prispieva k zlepšeniu našeho chápania regulačných mechanizmov v bakteriálnych genómoch a predstavuje nový prístup k typizácii kmeňov pomocou vzorov metylácie DNA. Poskytuje cenné poznatky o charakterizácii a klasifikácii bakteriálnych kmeňov na základe ich metylómov.
|
|
|
Typing of bacterial populations based on methylation site detection
Hlavatá, Kristína ; Sedlář, Karel (referee) ; Škutková, Helena (advisor)
Táto bakalárska práca sa zameriava na detekciu metylácií DNA a vývoj metodiky typizácie bakteriálnych kmeňov. DNA metylácie hrajú kľúčovú úlohu ako regulačný mechanizmus v genóme, ktorý ovplyvňuje konečné vlastnosti organizmov. Použili sme DeepSignal2 na detekciu metylačných vzorov v 10 kmeňoch Klebsielly pneumoniae. Okrem toho sme navrhli metódu typizácie na základe identifikovaných metylácií pre kategorizáciu bakteriálnych kmeňov. Táto práca prispieva k zlepšeniu našeho chápania regulačných mechanizmov v bakteriálnych genómoch a predstavuje nový prístup k typizácii kmeňov pomocou vzorov metylácie DNA. Poskytuje cenné poznatky o charakterizácii a klasifikácii bakteriálnych kmeňov na základe ich metylómov.
|
|
|
Electrochemical biosensor for the study of DNA methylation
Petrula, Jakub ; Hrdý, Radim (referee) ; Hynek, David (advisor)
This bachelor’s thesis deals with design and optimalisation of custom biosensor for detection of methylated DNA. Teoretical part explains the mechanism and importance of DNA methylation. Next section describes analytical methods used in connection with DNA methylation and some basic direct and indirect methods of detection. Final part is dedicated to experiment itself, which is divided into several sections. Section one deals witch modification of working electrode and optimalisation of detection method. Second section introduces two different ways of DNA methylation detection. First is based on direct detection and second one on detection through the biosensor. Final part shows determination of methylcytosine from sample based on analysing characteristic attributes of signal and numeric algorithm based on curve fitting.
|
guest ::
